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Internetportal zum Austausch von Vogelgrippe-Daten
Geschrieben am Montag, 08. September 2008 von firmenpresse
a3 systems unterstützt Max-Planck-Institut für Informatik beim Aufbau der GISAID-Plattform
GISAID, die Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data, fördert mit ihrer Internetplattform (http://platform.gisaid.org) jetzt den weltweiten Austausch von Grippe-Informationen. Die Plattform macht Daten aus allen Teilen der Welt für Wissenschaftler weltweit kostenlos zugänglich. Die GISAID-Plattform wurde von der Bioinformatik-Abteilung des Max-Planck-Institut für Informatik in Saarbrücken entwickelt. Sie vermittelt den Austausch unter den Wissenschaftlern und steuert den Zugriff auf die am Swiss Bioinformatics Institute im Rahmen der GISAID-Initiative angebotene EpiFlu-Datenbank, die die Grippedaten enthält. Beim Aufbau der Plattform kam das webbasierte dante® cms (Content Management System) vom saarländischen Softwarehersteller a3 systems GmbH zum Einsatz.
Die Bioinformatik-Abteilung des Max-Planck-Instituts für Informatik hatte sich 2007 für das dante® cms entschieden, um Projekte im Internet- und Intranetumfeld als eigenständige Entwicklungen durchführen zu können. "Anders als viele andere Content Management Systeme verbindet dante® die Vorteile eines kommerziellen Produkts mit denen einer Open-Source-Software", erläutert Professor Dr. Dr. Thomas Lengauer, Direktor am Saarbrücker Max-Planck-Institut für Informatik. "Beim Aufbau der GISAID-Plattform konnten wir auf viele Module out-of-the-box zugreifen. Fehlte eine Komponente, so hatten wir dank der offenen Architektur des dante® cms die Möglichkeit, objektorientiert hinzuzuprogrammieren. Dadurch konnten wir die gewünschte Mischung aus Modulen, wie z.B. Forum, Blog und Wiki, erzielen."
Weltweiter Austausch von Informationen zu Vogelgrippe-Erregern
Tauchen weltweit neue Fälle von Vogelgrippe-Erkrankungen – aber auch relevante Grippefälle in anderen Tierarten und beim Menschen – auf, so werden aus den Proben der Influenza-Erreger in Form von Aminosequenzen die genomischen Daten der jeweiligen Virusstämme identifiziert und in der EpiFlu-Datenbank abgelegt. Die in der EpiFlu-Datenbank gespeicherten Daten stehen für Analysen zur Verfügung, die Fragen nach der Evolution und Ausbreitung des Virus sowie der Entwicklung von Medikamenten und Impfstoffen nachgehen. Es wird erwartet, dass ihre Verfügbarkeit die Dynamik der Forschung über Vogelgrippe erleichtert und beschleunigt.
Sowohl die EpiFlu-Datenbank als auch ein Tracking-System, mit dem der Ursprung und Verlauf der gesammelten Proben verfolgt werden kann, wurden in die GISAID-Plattform integriert. Ein Single Sign-On ermöglicht den registrierten wissenschaftlichen Benutzern nach einmaliger Anmeldung den Zugriff auf alle Dienste der GISAID-Plattform.
GISAID, die Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data, fördert mit ihrer Internetplattform (http://platform.gisaid.org) jetzt den weltweiten Austausch von Grippe-Informationen. Die Plattform macht Daten aus allen Teilen der Welt für Wissenschaftler weltweit kostenlos zugänglich. Die GISAID-Plattform wurde von der Bioinformatik-Abteilung des Max-Planck-Institut für Informatik in Saarbrücken entwickelt. Sie vermittelt den Austausch unter den Wissenschaftlern und steuert den Zugriff auf die am Swiss Bioinformatics Institute im Rahmen der GISAID-Initiative angebotene EpiFlu-Datenbank, die die Grippedaten enthält. Beim Aufbau der Plattform kam das webbasierte dante® cms (Content Management System) vom saarländischen Softwarehersteller a3 systems GmbH zum Einsatz.
Die Bioinformatik-Abteilung des Max-Planck-Instituts für Informatik hatte sich 2007 für das dante® cms entschieden, um Projekte im Internet- und Intranetumfeld als eigenständige Entwicklungen durchführen zu können. "Anders als viele andere Content Management Systeme verbindet dante® die Vorteile eines kommerziellen Produkts mit denen einer Open-Source-Software", erläutert Professor Dr. Dr. Thomas Lengauer, Direktor am Saarbrücker Max-Planck-Institut für Informatik. "Beim Aufbau der GISAID-Plattform konnten wir auf viele Module out-of-the-box zugreifen. Fehlte eine Komponente, so hatten wir dank der offenen Architektur des dante® cms die Möglichkeit, objektorientiert hinzuzuprogrammieren. Dadurch konnten wir die gewünschte Mischung aus Modulen, wie z.B. Forum, Blog und Wiki, erzielen."
Weltweiter Austausch von Informationen zu Vogelgrippe-Erregern
Tauchen weltweit neue Fälle von Vogelgrippe-Erkrankungen – aber auch relevante Grippefälle in anderen Tierarten und beim Menschen – auf, so werden aus den Proben der Influenza-Erreger in Form von Aminosequenzen die genomischen Daten der jeweiligen Virusstämme identifiziert und in der EpiFlu-Datenbank abgelegt. Die in der EpiFlu-Datenbank gespeicherten Daten stehen für Analysen zur Verfügung, die Fragen nach der Evolution und Ausbreitung des Virus sowie der Entwicklung von Medikamenten und Impfstoffen nachgehen. Es wird erwartet, dass ihre Verfügbarkeit die Dynamik der Forschung über Vogelgrippe erleichtert und beschleunigt.
Sowohl die EpiFlu-Datenbank als auch ein Tracking-System, mit dem der Ursprung und Verlauf der gesammelten Proben verfolgt werden kann, wurden in die GISAID-Plattform integriert. Ein Single Sign-On ermöglicht den registrierten wissenschaftlichen Benutzern nach einmaliger Anmeldung den Zugriff auf alle Dienste der GISAID-Plattform.
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